More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0619 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0619  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 480 aa  980    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1067  lysyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.433368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1187  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0922785  hitchhiker  0.00801016 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2161  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000571826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 489 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 497 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 514 aa  428  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 503 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 502 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 511 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 508 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.91 
 
 		 498 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 578 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 1118 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 583 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 573 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 561 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0997  lysyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00135477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 647 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0707  lysyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.282019 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0488  lysyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0499  lysyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1142  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0716049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1755  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 482 aa  385  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>