More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1142 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1646  lysyl-tRNA synthetase  78.23 
 
 		 499 aa  816    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0488  lysyl-tRNA synthetase  70.14 
 
 		 500 aa  730    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  72.11 
 
 		 501 aa  762    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  71.71 
 
 		 501 aa  756    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  72.31 
 
 		 501 aa  761    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1142  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1031    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0716049  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  71.49 
 
 		 503 aa  760    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  72.87 
 
 		 503 aa  769    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1273  lysyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 504 aa  618  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507686  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 506 aa  608  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 501 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 492 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 510 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 501 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 501 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 492 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  48.06 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 503 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 489 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 513 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 489 aa  455  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  47.19 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  47.38 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 631 aa  444  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 502 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  46.99 
 
 		 496 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 506 aa  445  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 647 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 524 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 520 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3620  lysyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 515 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0836  lysyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>