More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0225 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  71.86 
 
 		 501 aa  758    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  71.66 
 
 		 501 aa  758    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  84.69 
 
 		 503 aa  903    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 503 aa  1023    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  63.97 
 
 		 506 aa  657    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0488  lysyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 500 aa  735    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  71.46 
 
 		 501 aa  756    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1646  lysyl-tRNA synthetase  68.08 
 
 		 499 aa  722    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1142  lysyl-tRNA synthetase  71.49 
 
 		 504 aa  760    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0716049  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1273  lysyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 504 aa  608  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 501 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 501 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 492 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 502 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 504 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 491 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 503 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50.83 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 510 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 501 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 505 aa  485  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 488 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  48.88 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  50.2 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  50 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  48.88 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0288  lysyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 514 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 524 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 504 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 489 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>