More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0997 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0997  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 569 aa  1145    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00135477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 577 aa  617  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  54.11 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  53.88 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 489 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 507 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 493 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 504 aa  445  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50.46 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 494 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 497 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  45.09 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 503 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  45.09 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 484 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 507 aa  432  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 518 aa  435  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  47.48 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 505 aa  432  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 502 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  47.9 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3250  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 515 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 492 aa  429  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 498 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  47.9 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 498 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 509 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0048  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>