221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06501 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  100 
 
 
352 aa  712    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  64.09 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  54.42 
 
 
319 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  48.08 
 
 
328 aa  206  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  44.6 
 
 
246 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  34.12 
 
 
732 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  35.05 
 
 
572 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  36.21 
 
 
434 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  30.59 
 
 
605 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  28.77 
 
 
673 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  31.46 
 
 
477 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  32.35 
 
 
632 aa  94  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  26.7 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  25.68 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  29.74 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  30.94 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  28.57 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  28.49 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  25.26 
 
 
687 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  27.37 
 
 
552 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  29.11 
 
 
161 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  27.27 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  36.46 
 
 
153 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  25.66 
 
 
559 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
196 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  27.71 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  29.65 
 
 
690 aa  59.7  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 
173 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  27.27 
 
 
1290 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  37.5 
 
 
128 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
98 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
98 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
102 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  36 
 
 
82 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
97 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 
253 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02310  conserved hypothetical protein  40.28 
 
 
444 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  36.71 
 
 
134 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  34.02 
 
 
724 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
148 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
132 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  38.96 
 
 
499 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
104 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
85 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
150 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
250 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
101 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
250 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
202 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  35.8 
 
 
86 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  40.26 
 
 
353 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
105 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  35.06 
 
 
104 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  26.8 
 
 
307 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
99 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
82 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 
103 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  33.77 
 
 
95 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  25.17 
 
 
151 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
102 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  34.07 
 
 
524 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 
94 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  27.88 
 
 
838 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04890  cytoplasm protein, putative  28.21 
 
 
706 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  31.03 
 
 
99 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 
94 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
95 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 
90 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 
94 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  35.06 
 
 
116 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
152 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
90 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  32.47 
 
 
95 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  35.06 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  31.33 
 
 
109 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
222 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 
95 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
95 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
241 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36.71 
 
 
151 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  33.33 
 
 
76 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
149 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
88 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
155 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
122 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
89 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
111 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
88 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  26.26 
 
 
194 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
89 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
137 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
91 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  25 
 
 
446 aa  50.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  24.64 
 
 
1121 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  31.71 
 
 
99 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
88 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  34.21 
 
 
222 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>