219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05001 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  100 
 
 		 1297 aa  2651    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  36.54 
 
 		 1016 aa  337  7.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  36.76 
 
 		 792 aa  331  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  46.82 
 
 		 176 aa  178  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22703  predicted protein  35.21 
 
 		 311 aa  147  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0386585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  33.7 
 
 		 382 aa  125  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  34.5 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  28.82 
 
 		 382 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  31.82 
 
 		 381 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  32.54 
 
 		 382 aa  112  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  28.44 
 
 		 377 aa  112  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  37.65 
 
 		 377 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  28.24 
 
 		 295 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  36.93 
 
 		 381 aa  106  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  34.66 
 
 		 288 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  34.66 
 
 		 288 aa  101  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  29.13 
 
 		 409 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  35.12 
 
 		 294 aa  99.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  29.03 
 
 		 296 aa  93.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45692  predicted protein  34.32 
 
 		 700 aa  90.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  26.79 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  24.17 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  28.04 
 
 		 377 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  27.54 
 
 		 377 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  27.14 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1727  3'-5' exonuclease  24.92 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  28.52 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  27.3 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  28.62 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  26.55 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  23.72 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  27.34 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  28.02 
 
 		 389 aa  74.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  25 
 
 		 371 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  27.64 
 
 		 382 aa  73.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  26.37 
 
 		 392 aa  74.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  26.84 
 
 		 392 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  24.58 
 
 		 392 aa  73.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  28.37 
 
 		 377 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  26.81 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  28.37 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  27.92 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  26.13 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  25.19 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  23.36 
 
 		 393 aa  72  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  22.74 
 
 		 369 aa  72  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  26.37 
 
 		 381 aa  72  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  26.81 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  26.33 
 
 		 442 aa  71.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  26.18 
 
 		 385 aa  70.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  27.24 
 
 		 384 aa  70.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  23.53 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  29.53 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  24.73 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  25.74 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000108089  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  27.69 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  29.07 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  25.45 
 
 		 375 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  25.45 
 
 		 371 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  25.45 
 
 		 375 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  24.47 
 
 		 385 aa  67.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  24.27 
 
 		 387 aa  68.2  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  25.45 
 
 		 375 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  25.45 
 
 		 375 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  23.02 
 
 		 369 aa  67.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  25.45 
 
 		 375 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  25.45 
 
 		 375 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  26.12 
 
 		 384 aa  68.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  25.45 
 
 		 371 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  24.65 
 
 		 427 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  23.53 
 
 		 386 aa  67.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  25.64 
 
 		 381 aa  67  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  24.54 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  25.09 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  24.6 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  29.65 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  26.53 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  25.27 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  25.27 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  25.27 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  24.81 
 
 		 374 aa  65.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  25.19 
 
 		 375 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  25.19 
 
 		 375 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  26.24 
 
 		 421 aa  64.3  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  25.18 
 
 		 384 aa  65.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  24.81 
 
 		 374 aa  64.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  25.19 
 
 		 375 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  25.98 
 
 		 386 aa  63.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  25.19 
 
 		 375 aa  64.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  27.54 
 
 		 392 aa  64.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  25.19 
 
 		 375 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  24.4 
 
 		 386 aa  63.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  24.39 
 
 		 408 aa  63.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  25 
 
 		 392 aa  63.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  23.53 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  25.48 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  27.54 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  25 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  23.88 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  23.67 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>