More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_12051 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  56.43 
 
 
603 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  63.67 
 
 
596 aa  784    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  63.44 
 
 
596 aa  782    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  55.86 
 
 
602 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  60.59 
 
 
619 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  59.86 
 
 
601 aa  758    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  96.27 
 
 
590 aa  1118    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  57.22 
 
 
591 aa  708    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  59.69 
 
 
601 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  57.89 
 
 
601 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  59.64 
 
 
596 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  59.52 
 
 
601 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  100 
 
 
590 aa  1177    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  85.93 
 
 
590 aa  1040    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  63.61 
 
 
596 aa  786    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  97.12 
 
 
590 aa  1129    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  52.27 
 
 
596 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  52.63 
 
 
625 aa  608  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  52.55 
 
 
595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  48.22 
 
 
620 aa  568  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  46.11 
 
 
595 aa  509  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  39.49 
 
 
660 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
650 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  41.89 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
658 aa  425  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  38.95 
 
 
648 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  36.43 
 
 
651 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  37.15 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  36.8 
 
 
638 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
639 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  35.36 
 
 
750 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  36.35 
 
 
962 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
575 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  32.99 
 
 
718 aa  392  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  33.97 
 
 
645 aa  362  8e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  34.89 
 
 
585 aa  359  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  34.34 
 
 
678 aa  357  5e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.32 
 
 
571 aa  346  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  36.33 
 
 
589 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.8 
 
 
571 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.8 
 
 
571 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.8 
 
 
571 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 
571 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 
571 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 
571 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
571 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.8 
 
 
588 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 
571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.55 
 
 
556 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 
571 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  35.41 
 
 
579 aa  334  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  34.01 
 
 
588 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
581 aa  333  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  38.65 
 
 
586 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.39 
 
 
581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  39.47 
 
 
468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.59 
 
 
582 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.51 
 
 
581 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.95 
 
 
611 aa  323  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  35 
 
 
589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  33.86 
 
 
617 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.92 
 
 
611 aa  320  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  31.75 
 
 
631 aa  320  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.49 
 
 
598 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
588 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.57 
 
 
640 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.34 
 
 
594 aa  316  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
594 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.26 
 
 
598 aa  316  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 
1257 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.45 
 
 
579 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  31.16 
 
 
576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.99 
 
 
572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.89 
 
 
586 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  30.8 
 
 
610 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.67 
 
 
572 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.44 
 
 
571 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.66 
 
 
580 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  36.53 
 
 
598 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.14 
 
 
601 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.8 
 
 
575 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  36.51 
 
 
578 aa  311  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  36.74 
 
 
604 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  31.86 
 
 
582 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.73 
 
 
584 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.59 
 
 
597 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.88 
 
 
592 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32 
 
 
572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.48 
 
 
588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  34.96 
 
 
671 aa  309  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.62 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  34.95 
 
 
612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  30.13 
 
 
613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.1 
 
 
587 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.25 
 
 
598 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  31.69 
 
 
582 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  36.55 
 
 
580 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.85 
 
 
587 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.33 
 
 
601 aa  306  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.72 
 
 
595 aa  306  8.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>