271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1452 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
291 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  99.66 
 
 
291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  97.59 
 
 
291 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  70.49 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 
274 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  36.9 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  34.31 
 
 
277 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 
274 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  36.13 
 
 
274 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 
296 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  35.61 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  36 
 
 
273 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  32.98 
 
 
304 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  36.27 
 
 
273 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  31.9 
 
 
281 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 
287 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 
285 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 
307 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 
338 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  37.76 
 
 
306 aa  105  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 
357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 
357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 
357 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 
357 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 
357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 
357 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 
357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  32.19 
 
 
359 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
317 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 
285 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
356 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
356 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 
356 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  36.04 
 
 
274 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  33.62 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  32.27 
 
 
355 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  36.08 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  34.85 
 
 
329 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  34.85 
 
 
330 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.76 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
332 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  34.01 
 
 
299 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  31.86 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.91 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  33.9 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  32.63 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  38.69 
 
 
369 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
317 aa  95.9  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  34.01 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  37.96 
 
 
367 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  36.72 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  35.05 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 
307 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  34.27 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.93 
 
 
348 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 
369 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  34 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.64 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  34.29 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 
348 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.52 
 
 
304 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 
306 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  35.59 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
336 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  32.45 
 
 
305 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  34.02 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  33.91 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  32.45 
 
 
305 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 
294 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  29.47 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
300 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
326 aa  85.5  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  33.99 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>