128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1030 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  98.84 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  94.15 
 
 		 171 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.26 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.99 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.06 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.57 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  46.62 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  39.75 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  40.36 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  39.38 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  39.69 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  38.19 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  37.88 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.27 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.17 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  31.58 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  35.83 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.54 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  37.96 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  40 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.2 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  37.27 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  39.78 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  38.14 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.45 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.45 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.45 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  39.64 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  37.23 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.54 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  35.45 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  34.95 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  33.87 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  33.87 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  33.87 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  33.06 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  32 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  33.03 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  32.26 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  34.31 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 332 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  32.04 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.56 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  31.73 
 
 		 332 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.04 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  30.19 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.74 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  29.29 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  26.52 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  28.35 
 
 		 372 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  30.48 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  38.82 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  34.29 
 
 		 458 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  37.8 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  36.92 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.83 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  29.41 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  41.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  29.81 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  35.19 
 
 		 659 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  27.12 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  32.81 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  29.55 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  38.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 118 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>