More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pBT9727_0061 on replicon NC_006578
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  82.19 
 
 
421 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  80.76 
 
 
424 aa  724    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  97.15 
 
 
421 aa  857    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  87.65 
 
 
421 aa  783    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  87.65 
 
 
421 aa  782    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  100 
 
 
421 aa  875    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  92.87 
 
 
421 aa  824    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  87.65 
 
 
421 aa  783    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  51.78 
 
 
420 aa  458  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  50.12 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  50.12 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  44.29 
 
 
417 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 
419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.17 
 
 
439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.05 
 
 
440 aa  264  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.05 
 
 
440 aa  261  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  33.19 
 
 
471 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  34.34 
 
 
471 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  36.06 
 
 
420 aa  249  7e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.34 
 
 
425 aa  245  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.69 
 
 
443 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  33.41 
 
 
421 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.03 
 
 
447 aa  223  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 
418 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  30.91 
 
 
507 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  31.37 
 
 
395 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.42 
 
 
399 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  27.2 
 
 
500 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  30.75 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  29.47 
 
 
400 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  32.33 
 
 
413 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  30.83 
 
 
408 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  28.57 
 
 
488 aa  153  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 
410 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  30.67 
 
 
409 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  30.28 
 
 
407 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  29.28 
 
 
529 aa  146  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  28.11 
 
 
414 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  29.68 
 
 
409 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.89 
 
 
409 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  29.09 
 
 
414 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  30.58 
 
 
432 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  26.25 
 
 
399 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  29.49 
 
 
410 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  28.07 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  29.11 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.09 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  27.18 
 
 
409 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  28.43 
 
 
409 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  30.49 
 
 
421 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  26.84 
 
 
393 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  28.08 
 
 
412 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  27.14 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  29.85 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  27.02 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  27.45 
 
 
397 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  27.53 
 
 
384 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  27.27 
 
 
412 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  27.53 
 
 
412 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  27.45 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  26.77 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  26.77 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  26.77 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  26.77 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  28.08 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  27.14 
 
 
412 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  26.77 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  26.88 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  27.01 
 
 
408 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  27.61 
 
 
423 aa  126  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  26.24 
 
 
411 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.78 
 
 
432 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  25.71 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  26.65 
 
 
420 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  25.49 
 
 
430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  26.15 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  25.69 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.39 
 
 
407 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  24.3 
 
 
386 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  25.32 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  24.94 
 
 
408 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  29.06 
 
 
385 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  27.5 
 
 
425 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  25.69 
 
 
385 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  23.96 
 
 
435 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  22.51 
 
 
421 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  25.13 
 
 
410 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  26.05 
 
 
448 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  23.92 
 
 
417 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  24.26 
 
 
385 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  23.95 
 
 
413 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  23.82 
 
 
431 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.9 
 
 
415 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  25.5 
 
 
432 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  23.74 
 
 
423 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  23.96 
 
 
429 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  26.06 
 
 
481 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  24.75 
 
 
413 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  23.76 
 
 
430 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>