More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0054 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
422 aa  868  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  92.4 
 
 
422 aa  812  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  87.83 
 
 
419 aa  769  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  75.06 
 
 
420 aa  661  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  2.99734e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  89.26 
 
 
439 aa  783  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  66.03 
 
 
420 aa  563  1e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  62.01 
 
 
418 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  58.29 
 
 
425 aa  494  1e-138  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  43.8 
 
 
419 aa  338  1e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  41.52 
 
 
405 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  41.06 
 
 
403 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.51154e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  38.8 
 
 
432 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  38.72 
 
 
404 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  36.39 
 
 
404 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.25 
 
 
415 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  37.24 
 
 
413 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  35.87 
 
 
427 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  35.73 
 
 
410 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  35.73 
 
 
414 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  35.66 
 
 
409 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  35.24 
 
 
409 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  33.5 
 
 
409 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  29.93 
 
 
414 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  29.68 
 
 
414 aa  181  3e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  34 
 
 
410 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  30.96 
 
 
440 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  31.28 
 
 
413 aa  175  2e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  30.86 
 
 
414 aa  173  6e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  31.91 
 
 
403 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  29.59 
 
 
406 aa  164  2e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  32.45 
 
 
413 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  32.13 
 
 
414 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.34 
 
 
389 aa  156  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  33.22 
 
 
293 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  30.68 
 
 
428 aa  147  4e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  29.37 
 
 
411 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  30.98 
 
 
410 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  30.29 
 
 
403 aa  142  1e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.34e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  30.52 
 
 
387 aa  141  2e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  29.4 
 
 
413 aa  141  2e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  27.87 
 
 
402 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  29.28 
 
 
515 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  29.75 
 
 
396 aa  139  8e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  31.49 
 
 
433 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29.82 
 
 
394 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  27.52 
 
 
404 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  30.25 
 
 
389 aa  137  3e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.55 
 
 
404 aa  137  3e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  29.55 
 
 
404 aa  137  3e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.43 
 
 
400 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  32.87 
 
 
399 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.11 
 
 
433 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.55 
 
 
404 aa  137  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  29.04 
 
 
481 aa  136  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.37436e-09  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.81 
 
 
426 aa  135  1e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  26.85 
 
 
390 aa  135  1e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  32.31 
 
 
404 aa  135  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.57 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  29.71 
 
 
401 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  25.87 
 
 
434 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  30.08 
 
 
395 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  8.24162e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  28.54 
 
 
400 aa  134  4e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  28.77 
 
 
412 aa  134  4e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  27.03 
 
 
404 aa  134  4e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  29.49 
 
 
415 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  26.79 
 
 
404 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1813  integrase family protein  31.14 
 
 
285 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.471749 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  29.7 
 
 
438 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  30.93 
 
 
396 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.68 
 
 
398 aa  132  8e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  28.78 
 
 
401 aa  132  8e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 
402 aa  132  8e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  28.11 
 
 
402 aa  132  8e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  27.25 
 
 
455 aa  132  1e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.93 
 
 
400 aa  132  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  7.70896e-14  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  29.21 
 
 
399 aa  132  1e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  28.92 
 
 
406 aa  132  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  27.96 
 
 
445 aa  132  1e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  27.15 
 
 
426 aa  132  1e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.08 
 
 
449 aa  131  2e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.05 
 
 
439 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  26.79 
 
 
404 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  27.76 
 
 
400 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  28.64 
 
 
395 aa  130  4e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.27 
 
 
404 aa  130  5e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  27.36 
 
 
418 aa  130  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  27.25 
 
 
418 aa  130  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  27.07 
 
 
422 aa  129  7e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  29.2 
 
 
394 aa  129  7e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  28.64 
 
 
418 aa  129  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  28.64 
 
 
418 aa  129  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  29.47 
 
 
387 aa  129  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  26.78 
 
 
446 aa  128  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  28.64 
 
 
420 aa  128  2e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  28.46 
 
 
413 aa  128  2e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  29.05 
 
 
418 aa  128  2e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  30.83 
 
 
406 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.46 
 
 
439 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.43 
 
 
402 aa  127  4e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  27.27 
 
 
443 aa  127  4e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>