208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0071 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0071  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  100 
 
 
474 aa  962  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.621553  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3466  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  60.55 
 
 
470 aa  600  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.811665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  59.7 
 
 
486 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1957  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  58.77 
 
 
476 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3501  pyridoxal-dependent decarboxylase  56.93 
 
 
464 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371632 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1409  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  57.08 
 
 
478 aa  514  1e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.557357  hitchhiker  1.01933e-05 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  43.64 
 
 
479 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3163  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  42.86 
 
 
478 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491116  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  45.76 
 
 
471 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0909  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  39.25 
 
 
486 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0883  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  39.46 
 
 
486 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2552  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  42.58 
 
 
470 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00803752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2788  aromatic amino acid decarboxylase  41.4 
 
 
471 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2867  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  41.4 
 
 
471 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1334  aromatic amino acid decarboxylase  41.19 
 
 
471 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2223  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  41.7 
 
 
470 aa  357  3e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.960692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3364  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  43.01 
 
 
470 aa  357  3e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  41.3 
 
 
474 aa  356  4e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1428  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  43.04 
 
 
476 aa  352  6e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3209  Pyridoxal-dependent decarboxylase  43.55 
 
 
579 aa  349  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1832  Pyridoxal-dependent decarboxylase  42.62 
 
 
475 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.536749  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5685  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  44.56 
 
 
462 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.025144  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00950  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, putative  32.34 
 
 
515 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.435109  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10299  aromatic-L-amino-acid decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02240)  32.14 
 
 
526 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  35.96 
 
 
502 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  30.46 
 
 
491 aa  217  3e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  35.57 
 
 
483 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  32.02 
 
 
510 aa  214  4e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.45 
 
 
489 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.41 
 
 
486 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.88 
 
 
529 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.32 
 
 
486 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  32 
 
 
492 aa  203  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  32 
 
 
497 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.35 
 
 
480 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.19 
 
 
484 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.98 
 
 
466 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  2.18274e-07  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.19 
 
 
484 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.19 
 
 
484 aa  191  3e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.19 
 
 
484 aa  191  3e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  33.47 
 
 
492 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4177  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.53 
 
 
484 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.37 
 
 
486 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.02 
 
 
460 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.05 
 
 
517 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5923  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.31 
 
 
483 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  0.358507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.51 
 
 
496 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.99 
 
 
530 aa  174  3e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.27 
 
 
515 aa  167  3e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  25.37 
 
 
479 aa  167  3e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30 
 
 
480 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2746  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.43 
 
 
463 aa  166  1e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2702  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.43 
 
 
463 aa  166  1e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2732  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.21 
 
 
463 aa  166  1e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.238333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  26.84 
 
 
515 aa  165  2e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.84 
 
 
515 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.62 
 
 
479 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3049  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.89 
 
 
471 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.46 
 
 
494 aa  163  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  28.5 
 
 
462 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.7 
 
 
551 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.93 
 
 
488 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.58 
 
 
477 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  26.6 
 
 
484 aa  157  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1440  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.03 
 
 
474 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.54 
 
 
490 aa  156  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.94226e-05  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.29 
 
 
495 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  24.71 
 
 
515 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.29 
 
 
495 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2925  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.05 
 
 
470 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.2 
 
 
529 aa  153  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.68 
 
 
508 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  2.43421e-05 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.98 
 
 
488 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2266  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.92 
 
 
517 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1241  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.03 
 
 
466 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.68 
 
 
507 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0060  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.71 
 
 
465 aa  148  2e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.474391 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.15 
 
 
458 aa  148  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03010  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  30.6 
 
 
442 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.94 
 
 
505 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0178  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.76 
 
 
462 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3871  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.59 
 
 
480 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  28.94 
 
 
511 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7120  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.19 
 
 
466 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00363554  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.85 
 
 
544 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  30.94 
 
 
489 aa  142  1e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1168  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.27 
 
 
482 aa  142  1e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1409  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.38 
 
 
474 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2413  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.96 
 
 
459 aa  140  4e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.23 
 
 
502 aa  139  9e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0743  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.52 
 
 
489 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  33.02 
 
 
453 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1181  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.34 
 
 
464 aa  137  3e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2377  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.54 
 
 
518 aa  138  3e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.48 
 
 
511 aa  137  3e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6192  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.36 
 
 
492 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.478239  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.8 
 
 
534 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2249  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.53 
 
 
471 aa  131  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198283  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  26.51 
 
 
961 aa  132  2e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.22861e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4423  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.18 
 
 
473 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.904496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>