More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3490 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 448 aa  882    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  74.58 
 
 		 444 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  77.51 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  69.52 
 
 		 405 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  72.18 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  71.93 
 
 		 402 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  59.76 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  59.35 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1214  secretion protein HlyD family protein  59.47 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.314397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  58.11 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  58.11 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  58.11 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  58.15 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  58.39 
 
 		 411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  58.15 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  58.15 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  58.39 
 
 		 411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  58.15 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  58.39 
 
 		 411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  60.36 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  60.97 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  57.25 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  59.03 
 
 		 407 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  58.23 
 
 		 410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  58.31 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  58.52 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  59.02 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  58.42 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  58.51 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  55.71 
 
 		 406 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  57 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4021  secretion protein HlyD family protein  52.48 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  53.17 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  50.61 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  55.43 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  51.69 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  51.57 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  50.76 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  51.22 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  53.49 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  49.26 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  50 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  51.26 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5574  secretion protein HlyD family protein  55.19 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6205  secretion protein HlyD  50.48 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1634  secretion protein HlyD family protein  49.76 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  50.13 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  49.59 
 
 		 400 aa  362  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  47.79 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  52.15 
 
 		 397 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  46.21 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  45.45 
 
 		 391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  49.6 
 
 		 372 aa  343  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  46.72 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  46.72 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  46.72 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  45.57 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  44.21 
 
 		 390 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  47.17 
 
 		 391 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  47.47 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  44.91 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  44.91 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  44.91 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  44.91 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  44.91 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  44.91 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  44.91 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  44.42 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  45.06 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  44.91 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  45.06 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  44.91 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  44.91 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  44.91 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  44.42 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  45.5 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  46.76 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3187  secretion protein HlyD family protein  48.53 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  43.99 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  52.1 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3230  secretion protein HlyD family protein  47.29 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1853  multidrug resistance transmembrane protein  47.4 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  41.86 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  41.86 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  41.86 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  41.86 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  41.86 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  41.86 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  41.57 
 
 		 387 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  40.9 
 
 		 387 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  46.35 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4503  secretion protein HlyD family protein  43.69 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  41.57 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5028  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4219  secretion protein HlyD family protein  47.95 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5191  secretion protein HlyD family protein  42.58 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3277  secretion protein HlyD  42.58 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5091  secretion protein HlyD family protein  42.58 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0562  HlyD family secretion protein  42.58 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2100  multidrug resistance protein  44.06 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>