More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01087 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  51.54 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  53.6 
 
 		 137 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  50 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  53.6 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  52.8 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  49.61 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  52.8 
 
 		 137 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  58.16 
 
 		 262 aa  124  9e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 275 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 275 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 266 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.4 
 
 		 124 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  52.07 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  53.45 
 
 		 125 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  45.33 
 
 		 249 aa  121  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  54.39 
 
 		 137 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  50 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.14 
 
 		 324 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  53.04 
 
 		 131 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.6 
 
 		 124 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  53.04 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  46.1 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 270 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 249 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 127 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  47.24 
 
 		 145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  50 
 
 		 114 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  56.44 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 367 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  52.8 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 360 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 360 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  58.24 
 
 		 239 aa  117  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  60.87 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 217 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 358 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  39.22 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 279 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  52.8 
 
 		 124 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 370 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  52.42 
 
 		 211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  63.41 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  55 
 
 		 243 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  56.86 
 
 		 254 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  54 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  56.57 
 
 		 342 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  56.57 
 
 		 341 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  54 
 
 		 293 aa  114  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 286 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 281 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  60.23 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 371 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  46.76 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  53.47 
 
 		 264 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  53.47 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  56.52 
 
 		 122 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  61.36 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61.36 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  50.81 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  45.99 
 
 		 139 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61.36 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  61.36 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  50.81 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  50.81 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  55.43 
 
 		 270 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  55.43 
 
 		 286 aa  112  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  50.93 
 
 		 324 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  53 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  56.38 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 381 aa  111  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 133 aa  111  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 255 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 335 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 337 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.49 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 339 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  56.52 
 
 		 297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 280 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  51 
 
 		 282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 342 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 280 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>