More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002676 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  96.31 
 
 		 284 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  86.97 
 
 		 284 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  83.04 
 
 		 284 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  74.56 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  63.51 
 
 		 281 aa  346  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  63.8 
 
 		 281 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  62.68 
 
 		 279 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  62.86 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  62.86 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  62.86 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  62.86 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  62.86 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  62.68 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  64.77 
 
 		 279 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  63.04 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  63.04 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  63.04 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  63.04 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  63.04 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  63.04 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  63.04 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  62.68 
 
 		 281 aa  338  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  65.02 
 
 		 283 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  65.02 
 
 		 283 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  60.99 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  64.53 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  62.68 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  60.99 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  60.99 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  64.64 
 
 		 283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  60.56 
 
 		 283 aa  333  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  62.14 
 
 		 281 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  64.23 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  62.98 
 
 		 279 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  61.83 
 
 		 283 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  58.67 
 
 		 285 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  57.14 
 
 		 285 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  59.53 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  59.92 
 
 		 265 aa  305  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  57.78 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  57.78 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  57.78 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  57.78 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  57.78 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  58.7 
 
 		 275 aa  291  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  39.58 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  40.49 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3166  glycerol uptake facilitator protein  62.42 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0972296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  42.31 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  39.69 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  40.77 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  40.77 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  39.02 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  36.52 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  38.63 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  38.64 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  41.15 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  39.46 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  38.46 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  36.56 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  39.53 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  40.84 
 
 		 251 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  36.62 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  37.18 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  40.56 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  37.55 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  36.16 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  34.67 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  40 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  40.96 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  38.27 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  40.96 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  41.06 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  41.06 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  41.32 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  41.32 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  40.89 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  40.91 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  36.89 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  40.89 
 
 		 235 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  40.08 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  38.46 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  40 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  34.43 
 
 		 449 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  34.66 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  36.44 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  40.42 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  39.67 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  37.89 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  40 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  40 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  35.63 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  36.63 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  40 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  40 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  35.45 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  40 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>