116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000442 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  100 
 
 		 522 aa  1077    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  83.11 
 
 		 533 aa  904    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  26.99 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  26.04 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  24.76 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  26.11 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  25.3 
 
 		 482 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  24.51 
 
 		 520 aa  123  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  25.13 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  23.94 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  26.22 
 
 		 789 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  23.35 
 
 		 474 aa  115  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  24.24 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  26.46 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  23.39 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  24.55 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  32.05 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  24.71 
 
 		 518 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  24.35 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  25.88 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  26.03 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  24.26 
 
 		 470 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  24.81 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  20.25 
 
 		 513 aa  94  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  23.21 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  23.21 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  23.29 
 
 		 534 aa  87  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  25.25 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  21.04 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  24.05 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  24.05 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  23.34 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  23.85 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  25.52 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  23.02 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  36.7 
 
 		 790 aa  77  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  21.24 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  36.94 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  36.28 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  27.59 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.4 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  32.48 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  32.48 
 
 		 627 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  22.13 
 
 		 373 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  32.48 
 
 		 630 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  32.48 
 
 		 638 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  32.48 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  32.48 
 
 		 653 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  28.5 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  22.43 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  30.48 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  32.73 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  30.48 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  22.36 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  30.48 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  31.43 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  27.43 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  27.43 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  21.69 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.43 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  22.38 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  21.21 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  31.13 
 
 		 354 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  22.82 
 
 		 366 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  32.56 
 
 		 346 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  27.86 
 
 		 366 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  23.48 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  30.19 
 
 		 352 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  23.48 
 
 		 373 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  23.48 
 
 		 373 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  23.48 
 
 		 373 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  23.48 
 
 		 373 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  23.48 
 
 		 373 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  23.48 
 
 		 373 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  27.27 
 
 		 791 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  33.64 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  29.23 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.23 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  32.14 
 
 		 372 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  27.74 
 
 		 623 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  34.19 
 
 		 344 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  21.48 
 
 		 337 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  25.74 
 
 		 454 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  29.84 
 
 		 369 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  29.2 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  24.17 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  29.2 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  25.74 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  25.98 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  29.36 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.97 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  28.57 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  28.24 
 
 		 347 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.91 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.41 
 
 		 343 aa  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  28.24 
 
 		 351 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  28.24 
 
 		 349 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  29.52 
 
 		 354 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  28.24 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  28.57 
 
 		 359 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>