More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3155 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  66.67 
 
 		 504 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  67.14 
 
 		 505 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  90.89 
 
 		 500 aa  927    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 498 aa  1026    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  82.76 
 
 		 496 aa  873    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  89.96 
 
 		 498 aa  932    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  56.43 
 
 		 499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  57.77 
 
 		 499 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  50.2 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  53.22 
 
 		 708 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  53.28 
 
 		 508 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  53.08 
 
 		 508 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  53.56 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  52.33 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  46.93 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  46.45 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  45.58 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  46.61 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  44.59 
 
 		 587 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  41.34 
 
 		 568 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  41.54 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  41.13 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  43.58 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  43.59 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  42.95 
 
 		 574 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  42.74 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  39.58 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  39.29 
 
 		 501 aa  346  6e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  42.63 
 
 		 585 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  41.79 
 
 		 526 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  42.59 
 
 		 808 aa  340  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  40.58 
 
 		 814 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  38.34 
 
 		 516 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  39.96 
 
 		 822 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  41.95 
 
 		 860 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  43.46 
 
 		 816 aa  333  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  39.87 
 
 		 494 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  40.75 
 
 		 506 aa  328  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  39.21 
 
 		 815 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  38.74 
 
 		 527 aa  323  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  39.96 
 
 		 824 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  37.11 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  37.76 
 
 		 522 aa  319  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  36.13 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  37.63 
 
 		 527 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  37.45 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  38.75 
 
 		 523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  37.33 
 
 		 513 aa  310  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  34.81 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  40.09 
 
 		 499 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  40.12 
 
 		 908 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  37.55 
 
 		 526 aa  299  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  40.21 
 
 		 873 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  38.11 
 
 		 891 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  36.64 
 
 		 493 aa  296  8e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  34.85 
 
 		 516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  36.71 
 
 		 799 aa  280  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  34.8 
 
 		 518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  34.8 
 
 		 518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  34.61 
 
 		 518 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  35.24 
 
 		 809 aa  274  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  34.61 
 
 		 518 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  35.17 
 
 		 810 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  35.56 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  33.83 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  34.83 
 
 		 520 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  34.83 
 
 		 520 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  34.38 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  34.17 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.13 
 
 		 503 aa  263  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  34.81 
 
 		 810 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  34.95 
 
 		 540 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 519 aa  260  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  35.96 
 
 		 610 aa  259  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  32.53 
 
 		 547 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  34.32 
 
 		 871 aa  259  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  34.94 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  34.94 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  31.96 
 
 		 528 aa  257  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  34.93 
 
 		 814 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  35.36 
 
 		 808 aa  256  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  36.79 
 
 		 680 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  34.73 
 
 		 537 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  35.92 
 
 		 799 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  32.61 
 
 		 847 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  36.02 
 
 		 534 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  33.82 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  34.42 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  36.02 
 
 		 537 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  33.52 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  33.88 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.28 
 
 		 497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  34.71 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  32.21 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  36.11 
 
 		 814 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  35.83 
 
 		 519 aa  243  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  34.24 
 
 		 827 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  34.41 
 
 		 540 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.08 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  34.13 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>