More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0166 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 
513 aa  1033    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  56.84 
 
 
507 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  38.45 
 
 
481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
466 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
466 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  29.3 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
1002 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.82 
 
 
1099 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  24.5 
 
 
694 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.1 
 
 
752 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 
1124 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.86 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 
1154 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  24.56 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
1101 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.31 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 
1120 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 
1118 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  23.1 
 
 
435 aa  66.6  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  25.19 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
475 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
222 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.98 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  26.19 
 
 
441 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
441 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.4 
 
 
424 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
236 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
495 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  26.19 
 
 
412 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  26.19 
 
 
441 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  26.19 
 
 
441 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  26.19 
 
 
441 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
651 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
651 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
651 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  24.4 
 
 
399 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  24.4 
 
 
399 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 
393 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  24.28 
 
 
412 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
222 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
471 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.13 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.99 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.53 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.31 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.72 
 
 
422 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  23.93 
 
 
425 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  23.93 
 
 
425 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.21 
 
 
397 aa  60.8  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  25.42 
 
 
365 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
401 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
226 aa  60.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
424 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  21.39 
 
 
418 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  23.28 
 
 
411 aa  60.1  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 
268 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1657  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
732 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0588308  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.18 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
549 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 
789 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 
789 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 
789 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  37.17 
 
 
301 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
445 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.67 
 
 
403 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  22.8 
 
 
423 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
396 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  22.97 
 
 
423 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  22.97 
 
 
423 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
802 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.3 
 
 
382 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
344 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
497 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
229 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
232 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>