More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3333 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  74.86 
 
 		 539 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  100 
 
 		 538 aa  1076    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  73 
 
 		 537 aa  756    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  41.15 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  36.61 
 
 		 545 aa  300  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  34.97 
 
 		 546 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  35.4 
 
 		 549 aa  282  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.54 
 
 		 539 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  35.48 
 
 		 584 aa  273  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  34.09 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  37.25 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  34.43 
 
 		 583 aa  259  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.96 
 
 		 543 aa  259  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  33.03 
 
 		 556 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  34.24 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 557 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  36.04 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.54 
 
 		 564 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.86 
 
 		 575 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.68 
 
 		 575 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  33.96 
 
 		 530 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  33.57 
 
 		 601 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.29 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  35.04 
 
 		 625 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.87 
 
 		 548 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  34.73 
 
 		 537 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  33.76 
 
 		 543 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 549 aa  226  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.76 
 
 		 546 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  32.8 
 
 		 606 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  33.33 
 
 		 564 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.1 
 
 		 520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.76 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  34.07 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.51 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.44 
 
 		 533 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.44 
 
 		 560 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  34.16 
 
 		 539 aa  213  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.6 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 540 aa  210  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  33.99 
 
 		 537 aa  209  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.47 
 
 		 581 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  29.51 
 
 		 604 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  33.51 
 
 		 525 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.04 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 620 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  28.14 
 
 		 522 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  28.14 
 
 		 522 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.14 
 
 		 522 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.6 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  32.02 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  32.02 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  32.02 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.85 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.39 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.48 
 
 		 522 aa  204  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.86 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  31.15 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 547 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  34.95 
 
 		 586 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 583 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  32.08 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  30.6 
 
 		 543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.59 
 
 		 522 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.59 
 
 		 565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 548 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 569 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  34.05 
 
 		 547 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  31.53 
 
 		 583 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.89 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.2 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 545 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  31.78 
 
 		 527 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  31.53 
 
 		 583 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 		 543 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.88 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  29.87 
 
 		 563 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 544 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  32.3 
 
 		 547 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.95 
 
 		 543 aa  193  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  30.92 
 
 		 557 aa  193  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.38 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  32.92 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 535 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 552 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 563 aa  190  7e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.45 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  30.16 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  31.96 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  30.94 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  32.04 
 
 		 554 aa  187  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 545 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  31.67 
 
 		 555 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 587 aa  186  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  28.13 
 
 		 592 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>