More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0980 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  40.09 
 
 
219 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  44.81 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.41 
 
 
222 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.63 
 
 
241 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  40.18 
 
 
224 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
657 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  37.32 
 
 
233 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  31.65 
 
 
241 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  38.81 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0785  HhH-GPD  36.15 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  36.19 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.22 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  35.65 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.68 
 
 
230 aa  112  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  37.74 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  37.95 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.23 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  37.43 
 
 
254 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.34 
 
 
222 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  37.43 
 
 
254 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  35.75 
 
 
208 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.32 
 
 
237 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  34.56 
 
 
235 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  36.13 
 
 
218 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  35.75 
 
 
219 aa  102  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  39.04 
 
 
222 aa  102  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  35.81 
 
 
238 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.56 
 
 
236 aa  102  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  33.33 
 
 
237 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.53 
 
 
239 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  34.76 
 
 
258 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  31.65 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  32.97 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  34.57 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  34.65 
 
 
219 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.65 
 
 
219 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  32.97 
 
 
267 aa  99  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  36.45 
 
 
221 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  35.14 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  35.32 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  30.23 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  34.29 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  30.33 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  33.33 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.42 
 
 
178 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  37.23 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  34.59 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  32.06 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  32.86 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  35.68 
 
 
212 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  35.68 
 
 
212 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  36.22 
 
 
212 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  34.59 
 
 
212 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  36.22 
 
 
212 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  30.33 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  33.17 
 
 
220 aa  95.1  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  34 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  35.78 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  34.05 
 
 
212 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  33.95 
 
 
246 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.92 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.76 
 
 
274 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.79 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.32 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  33.7 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  31.78 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.96 
 
 
277 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  34.05 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.87 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  32.26 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  32.97 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  32.06 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.2 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.07 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  32.06 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  32.62 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  34.05 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  34.39 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  33.33 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  32.62 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  35.36 
 
 
252 aa  92.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  32.24 
 
 
213 aa  92.4  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  34.13 
 
 
240 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.85 
 
 
212 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  33.17 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.22 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  30.09 
 
 
291 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  35.83 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.12 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.41 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  32.98 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  32.54 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>