More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0642 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  507  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  76 
 
 		 250 aa  384  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  42.75 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  39.29 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  39.08 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  41 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  38.96 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  40.25 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  40.25 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.2 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 249 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  44.59 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  39.41 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  37.85 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  42.33 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  38.82 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  40.69 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  39.42 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.59 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.44 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  37.35 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  37.35 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  37.71 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34.96 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  38.08 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  37.72 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  41.53 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  37.8 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  37.8 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  37.8 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  38.72 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  37.8 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  37.4 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 		 253 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  35.78 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.2 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  35.2 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  38.72 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.48 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  38.22 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.4 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>