More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2344 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  53.12 
 
 
228 aa  243  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  50.45 
 
 
228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.56 
 
 
252 aa  228  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.27 
 
 
236 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
259 aa  226  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
240 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.49 
 
 
267 aa  224  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.67 
 
 
257 aa  224  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  48.42 
 
 
236 aa  223  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.67 
 
 
253 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.67 
 
 
253 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  50.67 
 
 
225 aa  223  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.58 
 
 
226 aa  222  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  49.32 
 
 
236 aa  221  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  46.02 
 
 
254 aa  221  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 
246 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  47.51 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
249 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
248 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48 
 
 
249 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 
240 aa  218  8.999999999999998e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.58 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.44 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  43.18 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.46 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  45.58 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.9 
 
 
256 aa  215  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  48.2 
 
 
231 aa  215  5e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.11 
 
 
252 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.75 
 
 
254 aa  214  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
251 aa  214  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.13 
 
 
246 aa  214  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.35 
 
 
248 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0997  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.55 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.36 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.85 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.64 
 
 
251 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
267 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  46.85 
 
 
250 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.13 
 
 
246 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  45.58 
 
 
251 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 
244 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
258 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
249 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 
240 aa  209  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 
233 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  43.36 
 
 
243 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  43.23 
 
 
294 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.67 
 
 
257 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.45 
 
 
255 aa  208  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.42 
 
 
256 aa  208  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  46.7 
 
 
260 aa  208  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  45.13 
 
 
275 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  45.13 
 
 
254 aa  208  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.46 
 
 
266 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.02 
 
 
258 aa  207  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.46 
 
 
256 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  45.13 
 
 
271 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.02 
 
 
256 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  44.34 
 
 
238 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  46.9 
 
 
253 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
275 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
275 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  43.61 
 
 
231 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
256 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  44.2 
 
 
257 aa  206  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.25 
 
 
264 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
247 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
275 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
256 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
253 aa  206  3e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
275 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.58 
 
 
246 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  44.25 
 
 
247 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.25 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.25 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.25 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.25 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.25 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.25 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.25 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.18 
 
 
241 aa  205  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.69 
 
 
275 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.69 
 
 
275 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  44.2 
 
 
257 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.69 
 
 
275 aa  205  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.13 
 
 
258 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.58 
 
 
267 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.05 
 
 
256 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.16 
 
 
246 aa  204  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>