More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1683 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 589 aa  1208    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  61.95 
 
 		 589 aa  749    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  64.97 
 
 		 575 aa  776    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  53.87 
 
 		 607 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  52.22 
 
 		 607 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  55.45 
 
 		 591 aa  599  1e-170  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.4 
 
 		 587 aa  568  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  49.4 
 
 		 584 aa  557  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.11 
 
 		 585 aa  474  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.44 
 
 		 576 aa  455  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  43.53 
 
 		 589 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  45.09 
 
 		 582 aa  452  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  45.45 
 
 		 591 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  45.57 
 
 		 590 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.73 
 
 		 588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  45.28 
 
 		 591 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  45.85 
 
 		 591 aa  442  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  46.4 
 
 		 582 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  43.67 
 
 		 590 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.6 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  46.17 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  46.41 
 
 		 588 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  44.91 
 
 		 582 aa  440  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  45.92 
 
 		 589 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  47.67 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  44.47 
 
 		 592 aa  434  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  41.22 
 
 		 589 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  45.95 
 
 		 584 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  44.15 
 
 		 592 aa  431  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  45.53 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  44.28 
 
 		 586 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  43.54 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  42.65 
 
 		 601 aa  421  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  46 
 
 		 581 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  42.11 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  43.34 
 
 		 584 aa  415  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.44 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  44.47 
 
 		 586 aa  414  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  43.41 
 
 		 587 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  40.47 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  43.34 
 
 		 591 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.38 
 
 		 594 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  43.17 
 
 		 586 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  44.92 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  45.44 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  43.36 
 
 		 586 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  42.62 
 
 		 586 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  40.79 
 
 		 588 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  42.43 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  41.24 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  41.88 
 
 		 587 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  40.46 
 
 		 591 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  42.33 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  42.42 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  39.56 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  42.47 
 
 		 593 aa  369  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  41.9 
 
 		 617 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  43.1 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  42.16 
 
 		 594 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  39 
 
 		 623 aa  362  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  40.85 
 
 		 579 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  40.46 
 
 		 579 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  40.46 
 
 		 579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  40.04 
 
 		 524 aa  347  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.14 
 
 		 575 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  44 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  43.68 
 
 		 1065 aa  209  8e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.85 
 
 		 438 aa  125  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  31.11 
 
 		 427 aa  122  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  32.14 
 
 		 436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.84 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  32.62 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  28.96 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  30.63 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  33.48 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  30.45 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  32.11 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  30.56 
 
 		 442 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  27.82 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  30.63 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.02 
 
 		 462 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  30.12 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  28.36 
 
 		 440 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  30.37 
 
 		 436 aa  110  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  27.46 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.32 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  27.59 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.61 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.51 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.61 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  25.75 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.71 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  30.36 
 
 		 437 aa  108  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.04 
 
 		 484 aa  107  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.38 
 
 		 478 aa  107  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.48 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  28.08 
 
 		 487 aa  107  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  25.89 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  33.91 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  29.76 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>