141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0625 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  100 
 
 		 311 aa  593  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  76.45 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  50.17 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  48.71 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  47.19 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  51.16 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  46.42 
 
 		 292 aa  235  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  40.2 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  41.69 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  41.69 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  42.26 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  44.64 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  41.97 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  42 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  41.5 
 
 		 303 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  41.18 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  40.53 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  39.27 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  38.51 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  38.89 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  41.5 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  41.91 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  44.36 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  45.08 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  46.01 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  39.07 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  42.21 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  40.92 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  38.8 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  44.3 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  38.46 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  44.26 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  41 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  38.46 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  38.46 
 
 		 322 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  40.54 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  43.05 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  42.65 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  38.13 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  38.13 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  39.19 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  38.46 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  43.54 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  38.21 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  43.05 
 
 		 326 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  39.23 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  37.7 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  39.4 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  39.03 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  39.22 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  43.85 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  38.51 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  38.82 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  45.26 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  40.79 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  38.83 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  37.22 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  38.83 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  40.58 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  39.03 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  40.13 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  39.12 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  38.16 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  39.4 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  43.75 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  37.46 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  36.03 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  41.33 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  33.01 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  37.17 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  36.84 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  35.26 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  42.96 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  38.13 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  33.56 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  32.64 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  35.89 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  43.77 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  37.45 
 
 		 266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  27.06 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  30.07 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  32.73 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  31.8 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  29.18 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  31.93 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  34.07 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  35.27 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  34.44 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  31.74 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  30.55 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  26.75 
 
 		 438 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  34.44 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  29.86 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  31.49 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  31.62 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>