More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4872 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  64.02 
 
 
150 aa  201  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  63.12 
 
 
156 aa  177  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  50.64 
 
 
148 aa  165  3e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  48.8 
 
 
164 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  49.1 
 
 
159 aa  161  4e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56196e-07 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  48.8 
 
 
154 aa  161  4e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  49.1 
 
 
159 aa  161  4e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  4.1841e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  49.1 
 
 
159 aa  161  4e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  48.8 
 
 
154 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  47.59 
 
 
154 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  50.33 
 
 
164 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  50.33 
 
 
164 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  57.14 
 
 
196 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.56339e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 
188 aa  146  1e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  41.57 
 
 
166 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  44.44 
 
 
171 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  46.54 
 
 
162 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  50.41 
 
 
179 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  47.17 
 
 
162 aa  140  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  45.91 
 
 
154 aa  139  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  45.91 
 
 
154 aa  139  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
194 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
194 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  38.25 
 
 
190 aa  138  4e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  38.25 
 
 
190 aa  138  4e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  38.25 
 
 
190 aa  138  4e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.18421e-09 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
167 aa  138  4e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  46.45 
 
 
143 aa  138  4e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
189 aa  137  8e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  44.59 
 
 
189 aa  137  8e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  45.91 
 
 
154 aa  137  9e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  48.06 
 
 
205 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  45.73 
 
 
154 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  45.18 
 
 
162 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  46.63 
 
 
157 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  46.92 
 
 
172 aa  134  1e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  44.31 
 
 
154 aa  133  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  35.64 
 
 
191 aa  132  2e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  44.31 
 
 
154 aa  133  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  44.31 
 
 
154 aa  133  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  44.31 
 
 
154 aa  133  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  44.31 
 
 
154 aa  133  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  43.02 
 
 
154 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  43.02 
 
 
154 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  43.02 
 
 
154 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  43.02 
 
 
154 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  47.97 
 
 
147 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.10623e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  47.97 
 
 
147 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.43067e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  47.15 
 
 
193 aa  130  8e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  47.15 
 
 
194 aa  130  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  43.02 
 
 
154 aa  130  1e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  35.91 
 
 
191 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
155 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  42.07 
 
 
191 aa  128  5e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  42.77 
 
 
154 aa  127  7e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  47.83 
 
 
154 aa  126  1e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  47.83 
 
 
154 aa  126  1e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  47.83 
 
 
154 aa  126  1e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  47.83 
 
 
154 aa  126  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
171 aa  125  4e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  49.61 
 
 
153 aa  115  2e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  51.22 
 
 
152 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  44.12 
 
 
150 aa  107  8e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
214 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.96 
 
 
150 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
265 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.36 
 
 
173 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  35.96 
 
 
195 aa  101  6e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1884  NLP/P60 protein  40.29 
 
 
174 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.715704  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  39.67 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
207 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  33.53 
 
 
207 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  37.9 
 
 
240 aa  98.2  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  46.02 
 
 
169 aa  97.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  38.21 
 
 
333 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  37.72 
 
 
209 aa  97.8  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  33.83 
 
 
201 aa  97.4  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  31.96 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  4.4472e-09 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  36.28 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  38.76 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
246 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  36.49 
 
 
173 aa  95.5  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
216 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
246 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
223 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
223 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  40.18 
 
 
231 aa  94.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36.94 
 
 
177 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
266 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
209 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>