More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0567 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
333 aa  686  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  31.89 
 
 
331 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
345 aa  174  1e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 
345 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.87 
 
 
348 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 
348 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.87 
 
 
348 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 
354 aa  146  4e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 
364 aa  141  1e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 
363 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  30.86 
 
 
361 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  30.86 
 
 
358 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  28.21 
 
 
357 aa  132  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  31.89 
 
 
347 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  27.46 
 
 
348 aa  129  1e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 
367 aa  127  2e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 
349 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  30.9 
 
 
395 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  29.29 
 
 
341 aa  119  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 
383 aa  115  1e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 
383 aa  115  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 
349 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  32.86 
 
 
444 aa  112  7e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 
383 aa  111  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 
343 aa  111  2e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
353 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  27.3 
 
 
352 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.02 
 
 
335 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 
374 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 
377 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  25.87 
 
 
347 aa  99.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  26.89 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
398 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  28.19 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  26.11 
 
 
343 aa  80.5  4e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  33.11 
 
 
481 aa  77  4e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 
378 aa  75.9  8e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.85 
 
 
264 aa  75.1  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 
260 aa  74.7  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 
260 aa  74.7  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  26.25 
 
 
395 aa  75.1  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 
378 aa  73.2  6e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 
378 aa  71.2  3e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 
373 aa  70.9  3e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.49 
 
 
479 aa  70.5  4e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 
365 aa  69.7  7e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  26.38 
 
 
359 aa  68.6  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.44 
 
 
285 aa  68.2  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  29.37 
 
 
383 aa  67.4  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  30.29 
 
 
286 aa  67.4  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.12 
 
 
268 aa  67  4e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 
358 aa  66.6  5e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 
474 aa  66.2  6e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.93 
 
 
424 aa  66.6  6e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.73 
 
 
282 aa  66.6  6e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
480 aa  65.9  9e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
279 aa  65.1  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 
632 aa  65.5  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 
268 aa  65.5  1e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
279 aa  65.1  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 
632 aa  65.5  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  26.98 
 
 
280 aa  65.1  1e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 
513 aa  65.1  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
470 aa  64.7  2e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.90245e-07  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  34.53 
 
 
362 aa  64.7  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  29.14 
 
 
289 aa  64.7  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 
247 aa  64.7  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.48 
 
 
278 aa  64.3  3e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  32.19 
 
 
253 aa  64.3  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 
254 aa  63.9  4e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  29.73 
 
 
254 aa  63.9  4e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.61576e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  29.73 
 
 
254 aa  63.9  4e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  29.73 
 
 
254 aa  63.9  4e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  29.73 
 
 
235 aa  63.5  4e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.23036e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  29.73 
 
 
262 aa  63.5  4e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.05539e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  29.73 
 
 
254 aa  63.9  4e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.12622e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  28.51 
 
 
254 aa  63.9  4e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 
493 aa  63.5  5e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 
640 aa  62.8  9e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  32.88 
 
 
252 aa  62  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 
253 aa  62  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 
253 aa  62  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  33.56 
 
 
252 aa  62  1e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  28.07 
 
 
605 aa  62  1e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  33.56 
 
 
252 aa  62  1e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  33.56 
 
 
252 aa  62  1e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 
528 aa  62  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  33.56 
 
 
252 aa  62  1e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 
252 aa  62  1e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 
502 aa  62  1e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 
253 aa  62  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  33.56 
 
 
252 aa  62  1e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  32.52 
 
 
457 aa  62  1e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 
253 aa  62  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  30.46 
 
 
572 aa  61.6  2e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  30.46 
 
 
572 aa  61.6  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  25.96 
 
 
490 aa  61.6  2e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 
252 aa  62  2e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  30.46 
 
 
560 aa  61.2  2e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  30.46 
 
 
572 aa  61.6  2e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>