More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2333 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  65.22 
 
 
209 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  65.05 
 
 
209 aa  287  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  64.25 
 
 
209 aa  283  1e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  63.29 
 
 
209 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  63.9 
 
 
209 aa  277  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  61.35 
 
 
211 aa  273  1e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  58.57 
 
 
213 aa  268  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  61.31 
 
 
213 aa  262  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  59.42 
 
 
209 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  59.42 
 
 
209 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  59.71 
 
 
211 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.99657e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 
211 aa  254  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
210 aa  249  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  57.56 
 
 
208 aa  249  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  56.59 
 
 
211 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  246  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  55.61 
 
 
208 aa  244  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 
210 aa  243  2e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 
210 aa  243  2e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  54.67 
 
 
220 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 
213 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 
212 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  54.67 
 
 
220 aa  234  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.23614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 
210 aa  233  1e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.81863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  56.19 
 
 
212 aa  231  8e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.77342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  53.74 
 
 
220 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.05261e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
210 aa  228  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  52.17 
 
 
213 aa  226  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  54.37 
 
 
215 aa  225  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 
219 aa  224  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.63613e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  54.97 
 
 
211 aa  224  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  56.02 
 
 
211 aa  223  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  53.3 
 
 
217 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 
211 aa  222  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  51.64 
 
 
215 aa  222  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
210 aa  221  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 
211 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 
210 aa  220  1e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.31463e-05  hitchhiker  3.31617e-13 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
207 aa  220  1e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.58376e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.74 
 
 
206 aa  219  2e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 
209 aa  217  9e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.00637e-07  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  55.21 
 
 
212 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  55.21 
 
 
212 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 
212 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  1.67398e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 
213 aa  216  3e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  54.69 
 
 
212 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  48.13 
 
 
222 aa  213  1e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  48.58 
 
 
216 aa  214  1e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
212 aa  213  2e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 
218 aa  213  2e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
223 aa  213  2e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 
211 aa  212  3e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
207 aa  213  3e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.63563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
207 aa  213  3e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 
211 aa  211  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32976e-15 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.26 
 
 
209 aa  210  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
214 aa  210  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
205 aa  210  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  6.60439e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
207 aa  209  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.27 
 
 
209 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 
218 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 
218 aa  208  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
238 aa  208  5e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.49955e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  47.6 
 
 
210 aa  207  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
210 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 
219 aa  207  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  48.17 
 
 
218 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  47.64 
 
 
218 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  49.77 
 
 
220 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  48.31 
 
 
216 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 
221 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  46.54 
 
 
219 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  47.09 
 
 
226 aa  205  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  54.59 
 
 
208 aa  205  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  47.64 
 
 
218 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 
210 aa  203  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
218 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
217 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
217 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 
227 aa  203  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
217 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  47.26 
 
 
206 aa  202  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 
218 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  47.92 
 
 
219 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 
228 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  49.5 
 
 
208 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 
217 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  48.11 
 
 
220 aa  201  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  49.27 
 
 
247 aa  200  1e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.58145e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 
223 aa  200  1e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>