More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0953 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  45.98 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  47.06 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  47.06 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  43.05 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  46.46 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  48.73 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  47.3 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  47.75 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  44.14 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  43.81 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  45.29 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  44.59 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  43.12 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  44.64 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  44.64 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  47.72 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  46.88 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  45.36 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  45.05 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  43.18 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  40.36 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  44.59 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.7 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  40.62 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  44.95 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  40.35 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40.72 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 235 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  39.46 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  40.27 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  41.81 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 276 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.38 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.61 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  38.91 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.91 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  38.91 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  38.91 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  38.91 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.91 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  38.91 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.46 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  41.05 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  39.47 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  41.6 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  43.72 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  39.46 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  38.01 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  38.46 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.72 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.56 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  39.55 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  42.74 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  35.84 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08910  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.6 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0151637  hitchhiker  0.0000000329342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  42.71 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  44.06 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  37.61 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  36.51 
 
 		 272 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  42.38 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  38.29 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  43.22 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.43 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  40.27 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  40.7 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  40.47 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.64 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  43.22 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  37.44 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  38.86 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  38.5 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.17 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  39.22 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  36.56 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>