More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2277 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2277  thiolase  100 
 
 		 383 aa  769    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  65.34 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  61.9 
 
 		 385 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  60.53 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  64.17 
 
 		 381 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  59.38 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  60.05 
 
 		 383 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  58.47 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  59.64 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  57.03 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  56.77 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  56.51 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  55.97 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  54.74 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  54.97 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  50.53 
 
 		 382 aa  315  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.07 
 
 		 382 aa  311  9e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  49.47 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  51.09 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  49.03 
 
 		 389 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  48.16 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  40.42 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  40.32 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  39.52 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  40.05 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  41.86 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  42.38 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  39.79 
 
 		 379 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.05 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  41.19 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.86 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  39.73 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  42.31 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.95 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  40.63 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  40.26 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  39.46 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  39.43 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  39.57 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  43.24 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.08 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  39.46 
 
 		 382 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  43.33 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.68 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.24 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.98 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.68 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  39.32 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.26 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.05 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.9 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.55 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.02 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.42 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.39 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  33.69 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.7 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.56 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.51 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  36.16 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.86 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  34.2 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.77 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.79 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.3 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.46 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  33.95 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  34.29 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.45 
 
 		 388 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.45 
 
 		 388 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.45 
 
 		 388 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  32.98 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.69 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.99 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.87 
 
 		 378 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 388 aa  169  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  33.68 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.38 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.15 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  35.45 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  32.58 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  34.05 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  35.19 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.23 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.41 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  32.11 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.49 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.87 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.87 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>