More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0082 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0082  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
267 aa  507  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  64.91 
 
 
382 aa  275  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 
271 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0479  phosphomethylpyrimidine kinase  59.7 
 
 
249 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
288 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 
288 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 
288 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
283 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
308 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
267 aa  188  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
268 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
266 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50.74 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
271 aa  178  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
264 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
269 aa  176  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  35.98 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
484 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 
436 aa  171  7.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
497 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 
270 aa  171  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
297 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 
287 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  42.44 
 
 
531 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 
263 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
268 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 
271 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  48.33 
 
 
303 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  48.7 
 
 
303 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
269 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  40.23 
 
 
266 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
265 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 
494 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
273 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 
285 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  48.7 
 
 
301 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 
293 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
269 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  165  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
272 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 
518 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 
268 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 
299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  52.38 
 
 
290 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  41.35 
 
 
267 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  39.1 
 
 
266 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  39.1 
 
 
266 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 
290 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  39.1 
 
 
266 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  41.08 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  49.18 
 
 
272 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  39.1 
 
 
266 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
266 aa  161  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
492 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 
260 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 
282 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 
264 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
267 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 
260 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  46.32 
 
 
279 aa  159  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  52.59 
 
 
276 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
269 aa  158  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
267 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
267 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
262 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
284 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  38.35 
 
 
266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  41.89 
 
 
599 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
271 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  48 
 
 
267 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
264 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
266 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 
264 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  39.1 
 
 
266 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>