209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5332 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  423  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  66.18 
 
 		 205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  34.97 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0698  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  25 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  18.62 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  18.62 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  24.16 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  31.46 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.51 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  26.23 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  20.1 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  21.84 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  26.88 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  23.27 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  22.78 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  23.78 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  24.49 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  23.24 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  22.04 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  19.78 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  22.53 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  20.88 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  19.66 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>