102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3881 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  66.25 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  63.12 
 
 		 160 aa  203  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  60 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  58.75 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  60.62 
 
 		 186 aa  189  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  60.62 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  50.62 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  50.62 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  50.62 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  50 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  47.5 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  50.94 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  54 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  53.12 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  53.12 
 
 		 196 aa  151  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  42.5 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  43.75 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  48.63 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  45.95 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  28.57 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  30.19 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  27.88 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  27.88 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  27.88 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  24.05 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  27.27 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  27.27 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  27.27 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  27.16 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  27.61 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  28.38 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  28.38 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  28.38 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  28.57 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  28.57 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  28.76 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  31.29 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 		 652 aa  63.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  40.51 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  28.83 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  36.05 
 
 		 90 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  24.85 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  25.97 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  25.15 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 		 673 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 664 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  36.92 
 
 		 720 aa  50.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  36.92 
 
 		 671 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 		 674 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  52 
 
 		 544 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  32.79 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.75 
 
 		 697 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 672 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  32.79 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  54.17 
 
 		 662 aa  47.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  24.22 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 676 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  35.94 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 674 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.94 
 
 		 581 aa  43.9  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  23.21 
 
 		 650 aa  43.9  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 666 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  36 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  37.74 
 
 		 656 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 350 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 		 668 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 541 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 217 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 		 666 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 636 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.84 
 
 		 682 aa  42  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  24.49 
 
 		 233 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 		 568 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  25.69 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  31.94 
 
 		 399 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.26 
 
 		 355 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  25.64 
 
 		 213 aa  40.8  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>