63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3985 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 401 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  30.37 
 
 		 394 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000252983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  31 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  29.64 
 
 		 390 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  30.15 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  27.64 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  30.73 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  37.57 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3152  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  43.18 
 
 		 141 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.218767  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  40.38 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.62 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  29.5 
 
 		 433 aa  86.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  23.48 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  24.09 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  33.81 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  31.78 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  30.29 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  25.25 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  29.37 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.29 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  25.08 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  28.67 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.82 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.1 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.1 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.77 
 
 		 464 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  30.95 
 
 		 511 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1225  hypothetical protein  28.57 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.438073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.58 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  18.73 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  26.09 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.05 
 
 		 642 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  24.75 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.83 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.58 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  23.86 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  24.15 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  32.35 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  22.22 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  30.77 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.06 
 
 		 477 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  26.45 
 
 		 730 aa  47.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  26.12 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  27.61 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  29.6 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  25.66 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.39 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.89 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2552  hypothetical protein  27.88 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.814939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  27.48 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  24.8 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 547 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.93 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  24.32 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  21.77 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  20.9 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.35 
 
 		 465 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  23.88 
 
 		 589 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  28.66 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  21.19 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  27.59 
 
 		 556 aa  42.7  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>