23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2552 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2552  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.814939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1886  hypothetical protein  45.99 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0912016  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2349  hypothetical protein  37.97 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58537  hitchhiker  0.00897882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0162  hypothetical protein  24.48 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0941  restriction modification system DNA specificity subunit  23.37 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.172748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  30.82 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0613  hypothetical protein  22.58 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  25.9 
 
 		 402 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0991  restriction modification system DNA specificity subunit  24.6 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.603611  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  29.13 
 
 		 413 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.89 
 
 		 477 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.11 
 
 		 412 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  27.88 
 
 		 401 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 1362 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 		 730 aa  45.1  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.22 
 
 		 427 aa  44.7  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 		 629 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 		 485 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  28.57 
 
 		 416 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.33 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  25.32 
 
 		 453 aa  43.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  22.36 
 
 		 775 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 		 453 aa  41.6  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>