More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3742 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
483 aa  967    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.248268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  35.91 
 
 
594 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  35.91 
 
 
593 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  35.91 
 
 
615 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  35.91 
 
 
582 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  35.91 
 
 
582 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  35.91 
 
 
585 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  35.91 
 
 
576 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.75 
 
 
515 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  35.27 
 
 
601 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.58 
 
 
480 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  32.56 
 
 
519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.03 
 
 
552 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.86 
 
 
517 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.26 
 
 
509 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.47 
 
 
509 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.63 
 
 
517 aa  227  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  33.76 
 
 
514 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  34.33 
 
 
505 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.54 
 
 
604 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  31.71 
 
 
496 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  32.62 
 
 
475 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.62 
 
 
509 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.32 
 
 
525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.88 
 
 
543 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  34.89 
 
 
498 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.59 
 
 
483 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  34.1 
 
 
492 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.83 
 
 
529 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.4 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.26 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.26 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.81 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.19 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.04 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 
504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.92 
 
 
498 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.22 
 
 
502 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  31.14 
 
 
533 aa  210  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.12 
 
 
483 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  32.17 
 
 
489 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  29.24 
 
 
504 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.62 
 
 
493 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.19 
 
 
494 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  31.97 
 
 
496 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.03 
 
 
490 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  33.33 
 
 
490 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.75 
 
 
482 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  30.96 
 
 
488 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
499 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  32.21 
 
 
483 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.54 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.54 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.6 
 
 
498 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.6 
 
 
498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.58 
 
 
491 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.97 
 
 
527 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.8 
 
 
489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03952  predicted outer membrane factor of efflux pump  31.17 
 
 
488 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3912  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.17 
 
 
488 aa  200  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3947  putative outer membrane efflux protein MdtP  31.17 
 
 
488 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03912  hypothetical protein  31.17 
 
 
488 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4544  putative outer membrane efflux protein MdtP  31.17 
 
 
488 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4637  putative outer membrane efflux protein MdtP  31.17 
 
 
488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4325  putative outer membrane efflux protein MdtP  31.17 
 
 
488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  32.33 
 
 
502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.76 
 
 
498 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  32.61 
 
 
498 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  32.61 
 
 
493 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.83 
 
 
514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.61 
 
 
498 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.61 
 
 
498 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.61 
 
 
498 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.61 
 
 
514 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.79 
 
 
502 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.31 
 
 
498 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.19 
 
 
509 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.49 
 
 
499 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  30.79 
 
 
502 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.48 
 
 
502 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  30.47 
 
 
484 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.04 
 
 
515 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6556  putative outer membrane efflux protein MdtP  29.68 
 
 
494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3114  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.41 
 
 
475 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.02 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.02 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.02 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.02 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.02 
 
 
478 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.25 
 
 
629 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.79 
 
 
474 aa  186  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.55 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.75 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268118  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  29.72 
 
 
504 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3276  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.14 
 
 
616 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.14 
 
 
616 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0523348  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  35.2 
 
 
556 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5190  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.91 
 
 
618 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.09 
 
 
699 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3905  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.13 
 
 
483 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>