More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6556 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6556  putative outer membrane efflux protein MdtP  100 
 
 
494 aa  996    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  54.24 
 
 
488 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03952  predicted outer membrane factor of efflux pump  55.28 
 
 
488 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3912  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  55.28 
 
 
488 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3947  putative outer membrane efflux protein MdtP  55.28 
 
 
488 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03912  hypothetical protein  55.28 
 
 
488 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4637  putative outer membrane efflux protein MdtP  54.87 
 
 
488 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4325  putative outer membrane efflux protein MdtP  54.87 
 
 
488 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4544  putative outer membrane efflux protein MdtP  54.66 
 
 
488 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  37.2 
 
 
478 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  37.2 
 
 
478 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  37.2 
 
 
478 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  37.2 
 
 
478 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.99 
 
 
478 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0905  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.61 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.601202  normal  0.184806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2273  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.61 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1509  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.61 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2428  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.4 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0833  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.48 
 
 
478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2738  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.03 
 
 
501 aa  283  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3265  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.61 
 
 
478 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.028978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02068  predicted outer membrane protein  37.39 
 
 
454 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02026  hypothetical protein  38.65 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.33 
 
 
509 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  34.15 
 
 
489 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.19 
 
 
509 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  32.49 
 
 
519 aa  217  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.46 
 
 
498 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.46 
 
 
498 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.2 
 
 
502 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.99 
 
 
498 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.99 
 
 
498 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  31.96 
 
 
504 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.5 
 
 
498 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.65 
 
 
514 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.11 
 
 
489 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.25 
 
 
514 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.25 
 
 
498 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.25 
 
 
498 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.25 
 
 
498 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.22 
 
 
527 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  32.18 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.99 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.75 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.68 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  30.99 
 
 
493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  30.99 
 
 
498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  31.4 
 
 
502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.44 
 
 
552 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.53 
 
 
474 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.81 
 
 
498 aa  193  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  30.72 
 
 
502 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.92 
 
 
502 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  32.18 
 
 
496 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.18 
 
 
483 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.26 
 
 
699 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.96 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  31.51 
 
 
514 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.61 
 
 
604 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.29 
 
 
504 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  30.8 
 
 
475 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  30.45 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.29 
 
 
515 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 
505 aa  183  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.49 
 
 
529 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.18 
 
 
505 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.86 
 
 
702 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.95 
 
 
525 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.04 
 
 
515 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.8 
 
 
505 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.26 
 
 
553 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.26 
 
 
553 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.27 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  31.77 
 
 
615 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  31.77 
 
 
585 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  31.77 
 
 
594 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.42 
 
 
499 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  31.77 
 
 
576 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  31.77 
 
 
593 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  31.77 
 
 
582 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  31.77 
 
 
582 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.18 
 
 
543 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  29.52 
 
 
492 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.31 
 
 
509 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.18 
 
 
491 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1827  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.79 
 
 
527 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0730  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.79 
 
 
527 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.15 
 
 
482 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  32.37 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.65 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1014  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.79 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998145  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0191  putative outer membrane protein  31.79 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0815  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.79 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1916  Outer membrane protein  31.79 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  30.59 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.87 
 
 
509 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.72 
 
 
531 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.805675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0718  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.72 
 
 
531 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0239244  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0457  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.72 
 
 
531 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.555102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>