More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3633 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  727    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  77.54 
 
 		 363 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  76.72 
 
 		 335 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  76.72 
 
 		 335 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  76.42 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  76.42 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  75.82 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  77.01 
 
 		 335 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  75.52 
 
 		 335 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  77.01 
 
 		 335 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  74.71 
 
 		 380 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  72.86 
 
 		 353 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  73.95 
 
 		 335 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  77.43 
 
 		 321 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  53.63 
 
 		 338 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  52.35 
 
 		 338 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  50.89 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  51.93 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  50.29 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  33.45 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  36.61 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  27.66 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  32.22 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  32.6 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  30.56 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.91 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  32.6 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  31.29 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  31.72 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  32.6 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  30.14 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  27.22 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  32.23 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.88 
 
 		 699 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  33.57 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  31.25 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  34.42 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  31.25 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  29.06 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  32.72 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  31.65 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  29.69 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  29.69 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  29.21 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  31.98 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  29.69 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  29.56 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  26.87 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  28.91 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  29.02 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  28.9 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  30.15 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  29.81 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.46 
 
 		 701 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  27.38 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  30.97 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.07 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  32.4 
 
 		 408 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  29.41 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  29.21 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  27.62 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  30.43 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  30.38 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  32.7 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  27.91 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  29.48 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  29.3 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1198  hypothetical protein  27.44 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  28.84 
 
 		 308 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1192  hypothetical protein  27.44 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  31.05 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  28.12 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  30.98 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  28.8 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  28.69 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.21 
 
 		 399 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  29.43 
 
 		 392 aa  95.9  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  27.81 
 
 		 403 aa  95.9  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  26.25 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  31.86 
 
 		 396 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  30.88 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  30.66 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  27.84 
 
 		 397 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  25.76 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.73 
 
 		 715 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  25.76 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  30.89 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  26.94 
 
 		 493 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.71 
 
 		 713 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.71 
 
 		 713 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  31.2 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.8 
 
 		 713 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  26.46 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  26.77 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  25.93 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  29.97 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  25.57 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>