More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1551 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  98.02 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  97.36 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  90.43 
 
 		 303 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  86.8 
 
 		 305 aa  553  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  86.14 
 
 		 305 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  86.47 
 
 		 305 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  86.14 
 
 		 305 aa  550  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  82.84 
 
 		 304 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  67.44 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  68.33 
 
 		 303 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  68.44 
 
 		 302 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  67.67 
 
 		 302 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  65.67 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  71.38 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  67.22 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  59.42 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  60.71 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  58.47 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  56.63 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  49.3 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  49.02 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  48.43 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  46.89 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  49.31 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  48.45 
 
 		 313 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  45.96 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  45.58 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  46.71 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  46.55 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  46.39 
 
 		 321 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  46.18 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  46.18 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  45.49 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  40.62 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  43.06 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  40.2 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  39.32 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  43.51 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  36.73 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  33.54 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  34.26 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  36.1 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  34.91 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  33.03 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  32.48 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  29.33 
 
 		 385 aa  109  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  30.16 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  33.82 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  33.82 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  33.09 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  33.45 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  33.82 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  32.2 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  33.21 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  34.23 
 
 		 393 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  34.87 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  32.53 
 
 		 363 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  32.52 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.67 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  32.52 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  32.52 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  32.49 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  32.52 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  41.61 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.66 
 
 		 396 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  32.52 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  40.94 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  32 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  40.94 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.34 
 
 		 560 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  40.94 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  40.94 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  40.94 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  40.94 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  40.94 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  40.94 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  40.94 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.37 
 
 		 807 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  32.54 
 
 		 479 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  36.11 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 398 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  40.94 
 
 		 400 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  33.8 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  31.07 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 392 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  28.96 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  28.96 
 
 		 396 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  28.62 
 
 		 396 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  34.76 
 
 		 397 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  28.62 
 
 		 396 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  32.69 
 
 		 403 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  30.28 
 
 		 400 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  28.96 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  33.82 
 
 		 418 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  28.96 
 
 		 396 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  28.96 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>