More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2919 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  91.09 
 
 		 303 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  92.08 
 
 		 303 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  90.43 
 
 		 303 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  84.77 
 
 		 305 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  84.82 
 
 		 305 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  83.83 
 
 		 305 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  84.16 
 
 		 305 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  84.49 
 
 		 304 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  71.43 
 
 		 302 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  70 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  68.11 
 
 		 302 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  68 
 
 		 302 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  67.33 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  71.03 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  64.33 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  57.83 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  59.42 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  56.87 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  56.63 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  49.18 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  47.39 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  47.18 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  46.56 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  47.92 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  45.24 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  45.8 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  48.07 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  46.5 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  46.18 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  46.18 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  43.6 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  46.18 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  46.05 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  45.52 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  41.36 
 
 		 299 aa  235  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  40.48 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  41.81 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  37.63 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  31 
 
 		 385 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  34.66 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  33.82 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  33.82 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  33.23 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  33.82 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  34.66 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  33.09 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  32.13 
 
 		 353 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  31.5 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  33.09 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  35.74 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  30.09 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  34.02 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  33.09 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.28 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  31.45 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  32.36 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  29.39 
 
 		 389 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  30.91 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  29.48 
 
 		 392 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  33.18 
 
 		 393 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  29.12 
 
 		 384 aa  97.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  30.8 
 
 		 396 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  30.8 
 
 		 396 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  39.74 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  30.8 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  33.02 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  35.68 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.26 
 
 		 560 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  32.49 
 
 		 396 aa  93.6  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  38.41 
 
 		 400 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  30.62 
 
 		 479 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.79 
 
 		 807 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  30.42 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  30.42 
 
 		 391 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  30.42 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  40.29 
 
 		 400 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  30.42 
 
 		 396 aa  92  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  30.42 
 
 		 396 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  38.41 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  29.77 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  37.09 
 
 		 404 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  37.09 
 
 		 404 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  37.09 
 
 		 404 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  36.76 
 
 		 397 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  37.09 
 
 		 404 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  40.31 
 
 		 397 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  37.09 
 
 		 404 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.38 
 
 		 400 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  37.75 
 
 		 422 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  37.75 
 
 		 423 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  37.75 
 
 		 425 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  30.13 
 
 		 397 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  37.09 
 
 		 404 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  37.75 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  34.38 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  37.75 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  37.75 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  37.75 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>