More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1912 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  94.36 
 
 		 335 aa  630  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  94.36 
 
 		 335 aa  630  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  94.67 
 
 		 335 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  94.04 
 
 		 335 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  86.21 
 
 		 380 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  85.89 
 
 		 335 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  85.89 
 
 		 335 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  77.43 
 
 		 335 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  77.43 
 
 		 350 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  74.53 
 
 		 363 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  73.9 
 
 		 335 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  73.04 
 
 		 353 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  72.1 
 
 		 335 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  51.92 
 
 		 338 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  50.16 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  53.33 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  52.55 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  51.7 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  31.11 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  32.33 
 
 		 310 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  36.67 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  31.45 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  31.47 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  33.58 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  33.21 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  32.97 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  34.55 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  33.09 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  32.58 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  32.6 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  26.37 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  32.23 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  26.96 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  31.95 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  32.98 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  30.83 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  30.04 
 
 		 426 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  31.56 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  31.19 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  29.75 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28 
 
 		 701 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.48 
 
 		 393 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  29.48 
 
 		 393 aa  96.3  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  27.47 
 
 		 394 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  28.39 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  26.47 
 
 		 394 aa  95.9  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  29.69 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  32.09 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30.1 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  26.38 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  27.19 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.08 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  34.97 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.68 
 
 		 699 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  30.24 
 
 		 412 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  23.89 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  31.91 
 
 		 398 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  23.89 
 
 		 399 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  31.52 
 
 		 398 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  29.18 
 
 		 397 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  29.32 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  26.21 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  28.91 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  27.34 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  29.35 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  22.22 
 
 		 399 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  30.77 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  28.91 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  30.04 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  28.91 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  23.25 
 
 		 399 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  30.88 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  23.25 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  33.91 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  22.93 
 
 		 399 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  23.25 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  23.25 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  22.93 
 
 		 399 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  26.09 
 
 		 479 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  30.8 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  22.33 
 
 		 399 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  23.81 
 
 		 399 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  27.84 
 
 		 398 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  28.15 
 
 		 397 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  29.21 
 
 		 389 aa  89.4  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  29.62 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  28.87 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  32.02 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  31.37 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  35.06 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  31.03 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  25.25 
 
 		 493 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  30.26 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  30.37 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  32.19 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>