More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1462 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  40.51 
 
 		 560 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  39.45 
 
 		 839 aa  136  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  43.1 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  27.72 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  29.33 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  31.23 
 
 		 400 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  27.45 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  27.78 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  27.78 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  27.78 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  27.45 
 
 		 399 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  27.78 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  27.45 
 
 		 399 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  27.45 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  27.45 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  27.45 
 
 		 399 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.12 
 
 		 399 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  34.44 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.52 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  33.66 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  34.43 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  30.15 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  30.15 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  36.3 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.97 
 
 		 403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  39.51 
 
 		 412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  30.15 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  30.15 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  30.15 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  30.15 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  32.69 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.49 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.49 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.49 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  33.82 
 
 		 397 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  33.49 
 
 		 403 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  34.36 
 
 		 400 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.36 
 
 		 400 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  36.16 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  34.36 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.04 
 
 		 712 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  36.95 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  32.42 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  29.78 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  29.78 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.69 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  34.9 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  36.45 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  36.45 
 
 		 425 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  36.45 
 
 		 423 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  36.45 
 
 		 425 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  36.45 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  36.45 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  36.45 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  36.45 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  36.45 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  36.45 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  36.45 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  36.45 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  33.11 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.96 
 
 		 404 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  35.96 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.66 
 
 		 711 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  34.9 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  27.76 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  32.25 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.97 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  36.08 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  34.38 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  35.32 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  30.59 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.06 
 
 		 776 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  37.97 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 397 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.06 
 
 		 768 aa  109  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  31.88 
 
 		 552 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  36.45 
 
 		 400 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.6 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.28 
 
 		 807 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  32.65 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  28.71 
 
 		 397 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.62 
 
 		 709 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  32.82 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2658  hypothetical protein  34.81 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  32.34 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.62 
 
 		 709 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  32.46 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  31.72 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  33.93 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  33.82 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  33.82 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  34.46 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.08 
 
 		 711 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  35.96 
 
 		 400 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  33.17 
 
 		 479 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  33.96 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>