More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1491 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  636    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  64.92 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  66.33 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  64.92 
 
 		 305 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  66.33 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  65.67 
 
 		 303 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  65.33 
 
 		 305 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  64.57 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  64.33 
 
 		 303 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  64.67 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  64.03 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  64.78 
 
 		 303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  69.52 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  62.67 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  61.33 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  59.42 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  59.42 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  58.77 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  57.65 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  58.47 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  50 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  49.32 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  50.84 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  50.84 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  50.17 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  47.85 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  49.66 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  47.21 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  49.67 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  48.62 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  48.79 
 
 		 318 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  48.52 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  44.04 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  48.25 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  41.11 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  41.61 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  43.01 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  44.06 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  41.5 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  34.16 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  34.16 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  35.23 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  35.23 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  34.43 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  35.23 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  33.02 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  32.3 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  35 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  34.88 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  35.59 
 
 		 397 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  34.64 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  35.69 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  35.94 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  31.79 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  32.4 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  33.45 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  31.79 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  32.4 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  32.62 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.18 
 
 		 479 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  30.71 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  30.71 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  35.41 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  30.71 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  35.41 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  30.71 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  30.71 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  30.71 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  30.71 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  35.41 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  30.71 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  30.71 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  39.47 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  41.48 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.65 
 
 		 807 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.11 
 
 		 560 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  30.31 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  32.11 
 
 		 384 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  35.54 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  35.58 
 
 		 396 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  37.42 
 
 		 396 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  35.58 
 
 		 396 aa  99.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  35.58 
 
 		 396 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  30.31 
 
 		 403 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  30.31 
 
 		 403 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  28.32 
 
 		 493 aa  99  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  30.31 
 
 		 403 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  30.31 
 
 		 403 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  44.27 
 
 		 403 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.02 
 
 		 408 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  30.31 
 
 		 403 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  35.84 
 
 		 392 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  32.05 
 
 		 396 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.6 
 
 		 397 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.31 
 
 		 699 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.11 
 
 		 398 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  30.86 
 
 		 409 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  37.87 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  35.84 
 
 		 396 aa  95.5  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>