More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3357 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  71.52 
 
 		 319 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  70.89 
 
 		 319 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  71.43 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  60.45 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  60.77 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  59.81 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  60.06 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  59.81 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  59.81 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  59.74 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  58.6 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  60.71 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  59.16 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  56.82 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  56.17 
 
 		 303 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  55.19 
 
 		 302 aa  358  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  57.47 
 
 		 302 aa  358  8e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  57.79 
 
 		 305 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  59.32 
 
 		 305 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  45.3 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  45.86 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  44.52 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  44.37 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  44.85 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  45.71 
 
 		 313 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  45.83 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  42.55 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  42.62 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  43.13 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  42.9 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  42.9 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  42.9 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  38.93 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  42.03 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  37.91 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  35.35 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  35.95 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  39.79 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  30.51 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  31.52 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  35.02 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.59 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.92 
 
 		 560 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  29.63 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  32.62 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.82 
 
 		 479 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  27.89 
 
 		 394 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  29.72 
 
 		 396 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  29.41 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  34.03 
 
 		 400 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.03 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  29.62 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  28.08 
 
 		 393 aa  89.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  28.93 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  28.18 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.32 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  27.72 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  28.72 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  32.86 
 
 		 400 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  29.33 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  29.3 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  33.51 
 
 		 400 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  27.76 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  30.81 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  30.81 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.12 
 
 		 807 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  31.16 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  28.22 
 
 		 396 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  33.18 
 
 		 402 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  36.48 
 
 		 397 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  31.34 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  26.3 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  30.12 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  29.29 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  26.64 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  36.17 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  29.91 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  29.33 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  31.35 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  26.83 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  28.17 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  34.04 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  27.18 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.94 
 
 		 711 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  27.18 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.68 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  26.82 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  34.04 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  26.82 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  26.92 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  25.86 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>