More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4405 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  48.31 
 
 		 314 aa  292  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  46.58 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  46.23 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  42.18 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  42.41 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  42.71 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  43.05 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  42.61 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  42.51 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  42.86 
 
 		 321 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  42.86 
 
 		 318 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  41.75 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  40.19 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  43 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  43.05 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  43.06 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  43.05 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  41.61 
 
 		 308 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  43.05 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  41.29 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  42.71 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  42.71 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  40.6 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  42.32 
 
 		 304 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  41.36 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  41.26 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  39.46 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  42.76 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  42.91 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  38.93 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  37.46 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  36.81 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  36.25 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  37.83 
 
 		 305 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  39.79 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  36 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.94 
 
 		 560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  26.64 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  34.46 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  30.68 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  30.04 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  31.2 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  29.32 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  28.96 
 
 		 389 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  27.3 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.43 
 
 		 807 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1191  oxidoreductase  33.55 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2658  hypothetical protein  27 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.35 
 
 		 768 aa  94  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  25.84 
 
 		 493 aa  92.4  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  28.95 
 
 		 479 aa  92.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 400 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.35 
 
 		 776 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  28.93 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  27.89 
 
 		 393 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  29.8 
 
 		 390 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  28.03 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  28.09 
 
 		 393 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  28.57 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  28.57 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  26.02 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  28.03 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 409 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  30 
 
 		 398 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  31 
 
 		 397 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  27.71 
 
 		 393 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  26.61 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.18 
 
 		 713 aa  89.7  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  26.37 
 
 		 335 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  27.24 
 
 		 399 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  27.38 
 
 		 399 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  27.01 
 
 		 380 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  26.91 
 
 		 399 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27 
 
 		 399 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  28.68 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  27.11 
 
 		 411 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  30.14 
 
 		 402 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  32 
 
 		 402 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  30.84 
 
 		 399 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1192  hypothetical protein  29.21 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  26.97 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.9 
 
 		 711 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  26.98 
 
 		 397 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.93 
 
 		 707 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  28.12 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  27.85 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  27.46 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1198  hypothetical protein  29.21 
 
 		 390 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  28.21 
 
 		 396 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>