More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2468 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  633  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  73.72 
 
 
319 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  73.4 
 
 
319 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  71.75 
 
 
319 aa  447  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  58.31 
 
 
308 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  57.28 
 
 
305 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  57.65 
 
 
304 aa  364  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  57.28 
 
 
303 aa  364  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  56.96 
 
 
305 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  56.96 
 
 
305 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  57.61 
 
 
303 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  56.96 
 
 
303 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  57.28 
 
 
303 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  57.28 
 
 
305 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  57.33 
 
 
303 aa  360  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  54.72 
 
 
302 aa  358  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  55.02 
 
 
302 aa  355  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  53.07 
 
 
302 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  57.57 
 
 
305 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  57 
 
 
305 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  44.52 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  44.3 
 
 
310 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  47.27 
 
 
313 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  47.74 
 
 
313 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  45.63 
 
 
320 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  45.08 
 
 
313 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  43.69 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  45.39 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  45.39 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  45.39 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  45.39 
 
 
321 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  41.99 
 
 
321 aa  239  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  40.72 
 
 
318 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  43.23 
 
 
308 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  35.57 
 
 
309 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.96 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  36.57 
 
 
299 aa  218  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  41.84 
 
 
305 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  38.4 
 
 
320 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  31.61 
 
 
338 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.26 
 
 
408 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  37.62 
 
 
400 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  33.58 
 
 
400 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  37.13 
 
 
400 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.01 
 
 
560 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  29.55 
 
 
338 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  37.43 
 
 
400 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  27.74 
 
 
353 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  31.19 
 
 
392 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  40.74 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.23 
 
 
807 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  30.58 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  31.56 
 
 
397 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  33.68 
 
 
390 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  30.48 
 
 
385 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  30.49 
 
 
350 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.22 
 
 
338 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  29.39 
 
 
335 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.48 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  30.66 
 
 
493 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  32.16 
 
 
396 aa  92.4  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  29.78 
 
 
396 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  28.91 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  27.66 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 
402 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  31.02 
 
 
396 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  28.72 
 
 
363 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  31.02 
 
 
396 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  28.12 
 
 
415 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  31.18 
 
 
384 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  31.02 
 
 
396 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  28.14 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  36.05 
 
 
396 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  28.19 
 
 
380 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  36.05 
 
 
396 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  36.05 
 
 
396 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  33.01 
 
 
398 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  26.97 
 
 
389 aa  89.4  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  24.12 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  32.58 
 
 
390 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  32.58 
 
 
390 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  24.12 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  30.94 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  30.94 
 
 
391 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  24.44 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  30.94 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  24.12 
 
 
399 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  24.12 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  24.12 
 
 
399 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  24.12 
 
 
399 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  28.72 
 
 
335 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  24.12 
 
 
399 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  28.72 
 
 
335 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  28.72 
 
 
335 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  24.12 
 
 
399 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  26.32 
 
 
399 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.62 
 
 
397 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  27.03 
 
 
335 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>