More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1380 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  788    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  65.97 
 
 
384 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  50.26 
 
 
389 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  42.75 
 
 
399 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  43.19 
 
 
399 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  42.75 
 
 
399 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  42.56 
 
 
399 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  42.56 
 
 
399 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  42.49 
 
 
399 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  42.31 
 
 
399 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  42.31 
 
 
399 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  42.49 
 
 
399 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  40.51 
 
 
399 aa  292  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  42.75 
 
 
399 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  45.53 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  41.58 
 
 
390 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  41.58 
 
 
390 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  32.28 
 
 
402 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.44 
 
 
399 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.44 
 
 
399 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  33.96 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  31.97 
 
 
409 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.51 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.06 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  30.1 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  32.4 
 
 
397 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  27.09 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  25.63 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  27.09 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  27.09 
 
 
400 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  28.12 
 
 
396 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  27.1 
 
 
396 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  27.1 
 
 
396 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  26.83 
 
 
396 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  28.25 
 
 
400 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  26.63 
 
 
396 aa  146  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  28.1 
 
 
397 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  30.03 
 
 
479 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  27.55 
 
 
397 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  28.14 
 
 
418 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  28.57 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  25.51 
 
 
396 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  31.76 
 
 
839 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  24.52 
 
 
396 aa  136  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  25.75 
 
 
396 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  27.9 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  25.48 
 
 
402 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  26.48 
 
 
403 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  26.94 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  26.94 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  26.72 
 
 
396 aa  132  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  26.45 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.45 
 
 
560 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  26.8 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  26.48 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  26.48 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  26.48 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  26.48 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  25 
 
 
367 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  25 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  25 
 
 
367 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  25.2 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  27.72 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  25.27 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  25.9 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  25.34 
 
 
411 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  28.29 
 
 
409 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  27.27 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  27.27 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  27.27 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  27.27 
 
 
396 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  28.46 
 
 
393 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  26.4 
 
 
396 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  26.99 
 
 
552 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  32.3 
 
 
308 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  26.11 
 
 
413 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  31 
 
 
303 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  27.5 
 
 
391 aa  122  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  26.72 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  28.96 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1344  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.48 
 
 
732 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5734  oxidoreductase  35.32 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  28.93 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1192  hypothetical protein  31.08 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  28.33 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2204  PUA domain containing protein  25.46 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000936736  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  28.3 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.71 
 
 
713 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.49 
 
 
708 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  25.57 
 
 
412 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  25.28 
 
 
392 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  30.03 
 
 
417 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  27.78 
 
 
297 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  27.93 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  27.08 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>