More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5734 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5734  oxidoreductase  100 
 
 
365 aa  732    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.62 
 
 
713 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  49.11 
 
 
725 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24675  hypothetical protein  48.52 
 
 
343 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.94 
 
 
730 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.94 
 
 
730 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.62 
 
 
730 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.8 
 
 
730 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1344  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.06 
 
 
732 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  49.68 
 
 
725 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.22 
 
 
752 aa  288  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.35 
 
 
707 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.02 
 
 
750 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.35 
 
 
707 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.66 
 
 
721 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 
315 aa  281  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  47.02 
 
 
762 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1191  oxidoreductase  50.16 
 
 
321 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.03 
 
 
756 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.81 
 
 
738 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.58 
 
 
738 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.33 
 
 
725 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.83 
 
 
722 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  41.98 
 
 
335 aa  260  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.09 
 
 
707 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  42.76 
 
 
706 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.39 
 
 
708 aa  259  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.02 
 
 
711 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.81 
 
 
749 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.98 
 
 
712 aa  255  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.71 
 
 
705 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.91 
 
 
707 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.85 
 
 
702 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.74 
 
 
705 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.85 
 
 
702 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  41.85 
 
 
702 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.38 
 
 
702 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  41.85 
 
 
702 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.85 
 
 
702 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.38 
 
 
702 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.38 
 
 
702 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.27 
 
 
705 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.38 
 
 
702 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  41.85 
 
 
702 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.85 
 
 
702 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.38 
 
 
702 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.2 
 
 
702 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.74 
 
 
734 aa  250  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.06 
 
 
711 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.44 
 
 
712 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.94 
 
 
706 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.98 
 
 
702 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0688  putative RNA methylase  44.9 
 
 
734 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0808112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.83 
 
 
706 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.89 
 
 
711 aa  246  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.83 
 
 
706 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.37 
 
 
718 aa  245  9e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.83 
 
 
706 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.81 
 
 
702 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.98 
 
 
711 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.83 
 
 
708 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.19 
 
 
709 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2658  hypothetical protein  42.31 
 
 
325 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.75 
 
 
718 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.04 
 
 
715 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40 
 
 
709 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.46 
 
 
711 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.23 
 
 
699 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40 
 
 
709 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.98 
 
 
711 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.61 
 
 
711 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1312  THUMP domain protein  44.38 
 
 
768 aa  234  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530559  normal  0.0438625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.65 
 
 
776 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.65 
 
 
768 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.49 
 
 
713 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.49 
 
 
713 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.17 
 
 
713 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.22 
 
 
701 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0981  putative RNA methylase  42.45 
 
 
751 aa  229  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2214  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.82 
 
 
724 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.56 
 
 
709 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.56 
 
 
709 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2125  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.82 
 
 
748 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.842151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.58 
 
 
712 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.55 
 
 
807 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  40.6 
 
 
657 aa  216  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1014  THUMP domain protein  36.9 
 
 
760 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.520443  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  30.34 
 
 
385 aa  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  31.95 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  33.82 
 
 
409 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  32.88 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  34.12 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  34.54 
 
 
398 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  32.52 
 
 
399 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  32.52 
 
 
399 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  32.52 
 
 
399 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  32.52 
 
 
399 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  32.52 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  32.52 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  32.04 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>