More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2702 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  96.49 
 
 		 399 aa  767    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  100 
 
 		 399 aa  818    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  75.89 
 
 		 401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  72.41 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  71.61 
 
 		 409 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  70.74 
 
 		 398 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  65.4 
 
 		 398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  36.69 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  36.43 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  36.43 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  37.34 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.6 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  34.3 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  37.91 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  35.88 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  30.1 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  33.86 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  33.68 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  31.69 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  36.72 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  29.47 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  29.47 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  29.22 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.16 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  32.64 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  34.03 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  29.47 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  29.47 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  29.47 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  32.65 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  29.22 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  29.22 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  28.97 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  29.6 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  29.32 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  35.22 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.38 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.38 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  34.74 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  34.62 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.59 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  32.44 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.38 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  31.84 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  30.57 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  31.84 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  31.84 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  32.82 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.11 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.11 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  32.38 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.11 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  29.93 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  32.89 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.11 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  32.72 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  32.47 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  31.33 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  31.84 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  30.75 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  30.83 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  30.4 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  31.39 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.29 
 
 		 391 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  30.23 
 
 		 397 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  32.29 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  32.58 
 
 		 396 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  32.58 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  29.9 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  32.32 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  32.88 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  32.88 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  30.79 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  30.79 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  30.79 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  33.94 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  30.79 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  30.79 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  33.6 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  33.24 
 
 		 396 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  31.32 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  28.5 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  34.54 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  33.59 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  29.82 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  31.22 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  32.25 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  30.97 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  32.41 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  31.4 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  33.42 
 
 		 409 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  32.32 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  35.2 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  31.67 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  32.99 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  31.44 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  32.45 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  34.39 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  32.15 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>