More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0259 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 389 aa  788    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  50.26 
 
 		 385 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  50.78 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  49.62 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  48.48 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  48.22 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  48.22 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  48.22 
 
 		 399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  48.22 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  48.22 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  48.48 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  48.22 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  47.97 
 
 		 399 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  48.48 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  43.99 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  43.99 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  43.11 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  31.39 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  29.55 
 
 		 408 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  33.42 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  27.81 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.65 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.14 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  31.52 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  28.86 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  30.38 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  28.86 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  28.86 
 
 		 400 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  31.82 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.03 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  30.12 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  28.85 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  29.64 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  28.5 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  33.22 
 
 		 839 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  29.55 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  26.84 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  27.32 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  28.08 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  27.32 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  27.32 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  27.32 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  27.32 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  27.32 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  27.32 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  28.92 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  28.97 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  27.32 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  28.62 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  26.94 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  28.62 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  28.62 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  27.93 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  24.74 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  28.09 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  28.3 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  28.3 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  28.09 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  27.54 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  31.38 
 
 		 297 aa  146  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  26.2 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  27.74 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  26.2 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  26.2 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  26.2 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  26.2 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  27.59 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  27.16 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  26.15 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  30.03 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  29.43 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  29.79 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  26.4 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  29.51 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  29.17 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  27.78 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  27.78 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  27.78 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  27.06 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  27.78 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  27.54 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  29.31 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  29.79 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  27.78 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  26.17 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  26.5 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  27.76 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  26.33 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  28.78 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  29.7 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  25.77 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  25.19 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  24.48 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  29.17 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  28.57 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  24.87 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  25.32 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>