More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0667 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  802    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  77.95 
 
 		 390 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  77.95 
 
 		 390 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  45.45 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  45.19 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  44.92 
 
 		 399 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  44.92 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  44.92 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  44.92 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  44.92 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  44.65 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  45.45 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  44.92 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  43.48 
 
 		 399 aa  308  9e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  43.11 
 
 		 389 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  45.53 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  41.3 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.86 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  28.41 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  29.86 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  29.05 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  29.05 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  29.05 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  27.44 
 
 		 396 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  29.51 
 
 		 396 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  27.44 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  27.34 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  29.51 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  29.02 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  29.51 
 
 		 396 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  27.64 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  27.09 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.14 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  29.52 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  27.09 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  28.06 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  27.09 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.73 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  28.4 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  28.06 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  26.85 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  26.85 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  26.85 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  27.79 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  27.79 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  27.79 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  27.79 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.36 
 
 		 399 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  27.79 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  30.25 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  27.18 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  28.37 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  27.79 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  26.8 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  27.79 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  28.16 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  27.51 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  27.98 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  26.49 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  29.25 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  28.08 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  28.08 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  26.82 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  27.79 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  29.25 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  29.25 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  29.25 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  29.25 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  26.87 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  31.66 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  26.97 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  25.76 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  27.51 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  26.38 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  27.07 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  27.18 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  25.41 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  25.71 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  28.93 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  28.93 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  25.87 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  29.38 
 
 		 395 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  28.37 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  27.01 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  25.87 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  27.81 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  26.05 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  26.05 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  26.05 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  26.05 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  26.05 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  30.27 
 
 		 413 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  28.84 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  28.42 
 
 		 560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  28.62 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  25.82 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  28.85 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  29.64 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  27.5 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>